Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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