Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp46P62069 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp46P62069 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp46P62069 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp46P62069 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp46P62069 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp46P62069 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp46P62069 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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