Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppfia3P60469 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppfia3P60469 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms