Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhbdl3P58873 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rhbdl3P58873 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms