Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tpm2P58774 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tpm2P58774 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms