Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Paxbp1P58501 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Paxbp1P58501 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms