Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opa1P58281 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opa1P58281 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms