Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aqp4P55088 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aqp4P55088 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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