Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux1P53564 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux1P53564 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms