Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efnb1P52795 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms