Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa8P50706 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa8P50706 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms