Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt6aP50446 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms