Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gdf7P43029 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms