Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik2P39087 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik2P39087 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grik2P39087 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms