Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa2P31245 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms