Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd10P28359 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxd10P28359 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd10P28359 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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