Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gata3P23772 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms