Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EmbP21995 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EmbP21995 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EmbP21995 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms