Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkcaP20444 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkcaP20444 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms