Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NelfeP19426 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms