Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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