Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt8P11679 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt8P11679 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt8P11679 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms