Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PolP10400 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PolP10400 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PolP10400 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PolP10400 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms