Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms