Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AfpP02772 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AfpP02772 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AfpP02772 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AfpP02772 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AfpP02772 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms