Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casp8O89110 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Casp8O89110 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms