Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ShdO88834 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ShdO88834 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ShdO88834 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ShdO88834 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms