Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xirp1O70373 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xirp1O70373 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms