Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cited2O35740 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cited2O35740 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms