Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms