Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn6O35646 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Capn6O35646 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms