Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc18a3O35304 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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