Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn4O35054 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn4O35054 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms