Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltaO08585 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltaO08585 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltaO08585 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltaO08585 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms