Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alkal1J3QPP8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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