Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r58G3X9U3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms