Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms