Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r76F8VQ63 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r76F8VQ63 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms