Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8247F6VRJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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