Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5861F6VCN9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5861F6VCN9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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