Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms