Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brd1E9PZ26 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brd1E9PZ26 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms