Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3002E9PW72 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms