Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp839E9PUU5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms