Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cngb1E1AZ71 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms