Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc8D3YZV8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms