Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms