Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc13D3YV10 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms