Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3259D3YUK0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3259D3YUK0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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