Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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